SnapGene是一款专业的DNA序列分析工具，可以实现 DNA 可视化与克隆模拟，操作出错时智能提示，自动记录全部编辑操作，附带相关技术原理说明，方便学习和实验设计。软件适用人群广泛，学生、实验技术员、课题负责人、实验室管理者以及生物相关企业都可以使用，助力分子生物学相关研究工作。
SnapGene的引物设计
在序列视图中框选需要PCR扩增的目标片段区域，点击菜单栏【Primers】→【Design Primers】，启动引物设计工具。
在参数面板设置要求，Tm值区间、引物长度范围、GC含量阈值，开启发夹结构、引物二聚体风险筛查。
软件自动生成多组候选引物，列表展示每一对引物的 Tm 值、互补二聚体、发夹结构、错配风险评分。
挑选符合实验要求的引物，确认后将引物添加到序列注释，直接复制引物序列用于引物合成。
SnapGene使用安装指南
1、解压安装包，运行 EXE 安装程序。
2、选择安装路径，推荐使用非中文路径，也可保持默认路径。
3、阅读协议，勾选 i agree 同意许可协议。
4、按需勾选扩展组件，点击 next 继续。
5、确认设置后点击 install 开始安装。
6、等待安装完成，取消勾选立即运行，点击 finish 结束安装。
SnapGene应用介绍
In-Fusion克隆：首款支持模拟该无缝克隆技术的软件，选中 DNA 片段，自动生成融合引物。
Gibson组装：规划组装方案，自动完成引物设计，依靠片段重叠末端实现无酶连接。
限制性克隆：简洁界面展示所需信息，快速模拟克隆流程，提前识别克隆设计漏洞。
PCR与诱变设计：支持常规PCR、重叠延伸 PCR 和定点诱变模拟，生成的序列文件可继续编辑。
自动保存历史：每一次序列编辑、克隆模拟都会自动留存操作记录，历史记录可直接作为实验方案。
琼脂糖凝胶模拟：算法生成仿真凝胶图，支持对比真实电泳图片，方便验证酶切结果。
酶位点分析：高亮限制酶切位点，标记甲基化抑制位点，内置大量商用限制酶参数信息。
SnapGene温馨提示
(1)安装路径尽量不要使用中文文件夹，避免软件运行异常。
(2)凝胶模拟结果仅作方案参考，不能完全替代真实琼脂糖电泳实验。
(3)酶位点会受甲基化影响，设计实验时留意软件标注的甲基化阻断位点。